Los investigadores han aplicado la secuenciación del genoma completo para identificar genes específicos y cambios genéticos de interés en regiones genéticas previamente asociadas con el Alzheimer, con el fin de informar Futuras estrategias de tratamiento y prevención.y he identificado nuevas variantes genéticas asociadas a la enfermedadsegún lo publicado en la revista Alzheimer y demencia.
Identificar variantes genéticas y el papel que desempeñan en la predisposición a la enfermedad de Alzheimer puede ayudar a los investigadores entender mejor cómo tratar esta enfermedad neurodegenerativa para la que actualmente no existe cura.
La investigación, liderada por la Escuela de Salud Pública de la Universidad de Boston (BUSPH) y la Escuela de Salud Pública UTHealth de Houston (Estados Unidos), utilizó la secuenciación del genoma completo e identificó 17 variantes significativas asociadas con la enfermedad de Alzheimer en cinco regiones genómicas. Estos datos permiten a los investigadores identificar genes y variedades raros e importantesa diferencia de los estudios de asociación de todo el genoma, que se centran únicamente en variantes y regiones comunes.
«Estudios anteriores de asociación genómica utilizando cepas comunes han identificado regiones del genoma, y a veces genes, que están asociados con la enfermedad de Alzheimer», dice el Dra. Anita DeStefano, coautor del estudio y profesor de bioestadística en BUSPH. Los datos de la secuencia completa del genoma interrogan cada par de bases del genoma humano y pueden proporcionar más información sobre qué cambio genético específico en una región puede estar contribuyendo al riesgo o la protección de la enfermedad de Alzheimer.
Fases del estudio
Para el estudio, los investigadores realizaron análisis de asociación de variante única y pruebas de asociación de agregación de variedades raras utilizando datos de secuenciación del genoma completo del Proyecto de secuenciación de la enfermedad de Alzheimer (ADSP), una iniciativa de genética que los Institutos Nacionales de Salud desarrollaron en 2012 como parte del objetivo de Ley del Proyecto Nacional de Alzheimer para tratar y prevenir la enfermedad. Los datos ADSP incluyen más de 95 millones de variantes entre 4.567 participantes con o sin la enfermedad.
Entre las 17 variedades importantes que estaban relacionadas con la enfermedad de Alzheimer, La variante KAT8 fue una de las más notables., ya que se asoció a la enfermedad tanto en el análisis de variantes únicas como en el de variantes raras. Los investigadores también encontraron asociaciones con varias variantes raras de TREM2.
«Al utilizar la secuenciación del genoma completo en una muestra diversa, pudimos no sólo identificar nuevas variantes genéticas asociadas con el riesgo de enfermedad de Alzheimer en regiones genéticas conocidas, sino también Caracterizar si las asociaciones nuevas y conocidas son compartidas entre poblaciones.«dice el Dra. Chloé Sarnowskicodirector y autor del estudio y profesor asociado en el Departamento de Epidemiología de la Escuela de Salud Pública de UTHealth Houston.
El ADSP incluye participantes de diversas etnias y evaluaciones específicas de la población centradas en Subgrupos de ascendencia blanca/europea, negros/afroamericanos e hispanos/latinos, así como en un metanálisis multipoblacional. «Incluir a participantes que representen diversos ancestros genéticos y orígenes diversos en términos de determinantes sociales de la salud es importante para comprender el espectro completo de riesgo de la enfermedad de Alzheimerya que tanto la prevalencia de la enfermedad como las frecuencias de variantes genéticas puede diferir entre poblaciones«Destaca DeStefano.
Expectativas para futuros estudios.
En estudios futuros, los investigadores esperan examinar las variantes específicas de la población que identificaron en tamaños de muestra mucho más grandes, así como explorar cómo estas variantes afectan el funcionamiento biológico.
«Actualmente estamos trabajando para ampliar esta investigación para poder utilizar la secuenciación del genoma completo con tamaños de muestra más grandes en ADSP para examinar el conjunto completo de variantes genéticas, no solo dentro de las regiones genéticas conocidas de la enfermedad de Alzheimer, sino en todo el genoma», concluye el Dra. Gina Pelosocoautor principal y profesor asociado de bioestadística en BUSPH.